「ニャンコフェリー」が運航しているジャンボフェリーは、朝便と昼便、夜便は約3時間強、深夜便は約6時間半の所要時間で、神戸と小豆島を結んでいます。

平日ダイヤと土休日ダイヤは異なり、土休日ダイヤは、2月と6月の定期検査時を除くすべての土日祝日、GWとお盆、年末年始が対象です。

行き（往路）のみ、大型車を除く土休日ダイヤ便と深夜便の利用者には、土休日ダイヤ料金と深夜料金が追加されます。

大型車や普通車、軽自動車での利用には、燃料価格高騰のため、車両運賃のほかにも燃油サーチャージが必要です。

車での乗船は、往復のWEB予約で往路が5％、復路が10％割引されるサービスがあります。

また、復路10％割引券がついている乗船名簿をプリントアウトして窓口に持参し、現金で乗船券を購入すると、燃油サーチャージ、土休日ダイヤ料金や深夜料金を除き5％割引となります。

ジャンボフェリーに乗船すると、ジャンボフェリー乗船証となるチケットの半券を小豆島の提携施設に提示することで割引サービスや特典が受けられます。

有効期限は、半券の発行日から5日間となっています。

そのほか、各地の高速バスとフェリーのセットや、USJなどの観光地を結ぶバスとフェリーのセットでお得なチケットも販売中です。

神戸側には、神戸フェリーバスが運行する三宮と神戸港を結ぶ路線バスがあり、必ず出発するフェリーに接続しているほか、神戸港から三宮への路線バスもフェリーの到着に合わせて運行されています。